Чтобы активировать постоянные ссылки WordPress и nginx в конфиге нужно прописать это
try_files $uri $uri/ /index.html; строкой try_files $uri $uri/ /index.php?q=$uri&$args;

Например:

location / {
try_files $uri $uri/ /index.php?q=$uri&$args;
}