Столкнулся с тем, что после установки Exchange 2010 и наката на него Update RollUpPack 2 перестал работать OWA. Возникает пустое окно браузера с ошибкой, в том что что-то не так с flogon.js
Полез смотреть, все файлы на месте, но интересная штука творилась в IIS. Там появился еще один контейнер с версией эксчендж, но страничка почему-то ссылается на старую версию. В общем нифига не поняв полез в инет. Вроде как лечится вследующим образом:
Запускаем командную строку от имени администратора и через нее запускаем установку самого пакета обновления. Таким образом он получит все привелегии при установке и проблема уйдет.